天珠的起源可追溯到公元前3000年至1500年之間，阿利安人的印度古國。當時的人們為求神佛庇佑，天珠因此被創造出來。當時人們以古老文獻<吠陀經>中記載的咒術、圖騰等符號圖案造型(也就是現在天珠上的各種圖案)，畫于石材上，進于達到提升精神(靈魂)意識的效益。依《吠陀經》記載：遠古時因受地理環境及天然災害的影響，求神助佑之心自然產生，“天珠”因而被創造出來。同時，滲進了各種藥物治病，并用巫術咒語的圖騰意念，符畫于石材上，借以獲得諸佛眾神的加持與護佑。

    天珠用于敬奉佛菩薩之事跡具代表性的記載為唐太宗貞觀十五年（公元六四一年）文成公主下嫁吐蕃贊普松贊干布時，帶了一尊從印度請來的佛像作為陪嫁，最后這尊佛像坐落西藏拉薩大昭寺的釋迦殿內，而這尊佛像即被西藏人民鑲上了百余顆各式各樣的天珠，包括三顆九眼天珠，及三眼天珠、二眼天珠、寶瓶天珠（或稱永生瓶天珠）、虎紋天珠和其它帶眼天珠。目前這尊佛像安奉于拉薩(Lhasa)大昭寺的釋迦殿內。

    據史料記載，于圓和吐蕃之間的草原信道，是西藏與北方草原文化進行交流的重要途徑，這條古道至少在公元前5世紀便已開通。悠久的歷史，美麗神秘的傳說，加之西藏人虔誠地收藏供養，世代相傳，天珠便成為人們心中中珍貴的寶物了。